Есть в Linux очень хороший эмулятор NES — fceu. Одна только проблема: у него нет графического интерфейса, а в параметрах командной строки запутаться недолго.
Вот мой скрипт для предания fceu хоть какой-то гуёвости:

#!/bin/sh
# fceu GUI by 2lx.ru
GAME="/usr/bin/fceu"
while [ -f "$GAME" ]
do
GAME=$(zenity --title "FCEUltra - Select a game to play" --window-icon=/icon/for/zenity/window --file-selection)
DIR=$(dirname "$GAME")
cd "$DIR"
/usr/bin/fceu -xres 800 -yres 600 "$GAME"
done